船舶抵押权纠纷是指当事人之间因船舶抵押权的设立、变更、转让、实现及保护而产生的民事争议。核心在于明确船舶抵押权的效力和行使规则，保障抵押权人的债权实现，同时兼顾船舶抵押人的合法权益。常见场景包括船舶抵押合同签订后因未办理抵押登记引发的效力争议，抵押权人在债务到期后主张实现抵押权（如拍卖、变卖船舶优先受偿）引发的纠纷，抵押人擅自处分已抵押船舶导致的抵押权侵权纠纷，船舶抵押权与其他担保物权（如留置权）的行使顺序争议，因抵押船舶毁损、灭失导致的抵押权实现争议等。
法律规定：核心依据为《中华人民共和国民法典》物权编关于抵押权的相关规定；《中华人民共和国海商法》第十一条至第十九条（关于船舶抵押权的专门规定）；《中华人民共和国船舶登记条例》（关于船舶抵押权登记的规定）；《最高人民法院关于审理船舶物权纠纷案件具体应用法律若干问题的解释》。
认定要点：船舶抵押权设立的认定，审查船舶抵押权是否依法设立，即是否签订合法有效的抵押合同，是否办理船舶抵押登记；船舶抵押权自抵押合同生效时设立，登记为对抗要件，未登记的不得对抗善意第三人。抵押权效力的认定，审查船舶抵押权的效力范围（包括主债权及其利息、违约金、损害赔偿金、实现抵押权的费用等），抵押船舶的范围（是否包括船舶附属设施、未来收益等）；需结合抵押合同约定和法律规定综合判断。抵押权实现条件的认定，审查抵押权人主张实现抵押权的条件是否成就，即主债权是否到期未清偿，抵押权是否合法有效，是否存在阻碍抵押权实现的法定或约定情形（如抵押合同约定的实现条件未成就）。抵押权行使顺序的认定，审查船舶抵押权与其他担保物权（如留置权、其他抵押权）的行使顺序，根据法律规定，船舶留置权优先于抵押权受偿，同一船舶上多个抵押权按登记先后顺序受偿，顺序相同的按债权比例受偿。
民事责任承担方式：确认抵押权责任，判令确认船舶抵押合同有效，确认抵押权人对抵押船舶享有合法的抵押权。实现抵押权责任，判令抵押权人对抵押船舶折价、拍卖、变卖所得的价款在主债权及相关费用范围内享有优先受偿权；若抵押船舶已毁损、灭失，判令抵押权人对船舶保险赔偿金、损害赔偿金等代位物享有优先受偿权。赔偿损失责任，判令抵押人赔偿因擅自处分抵押船舶、未履行抵押义务给抵押权人造成的损失（如抵押权无法实现的债权损失、实现抵押权的额外费用）；判令侵权人赔偿因侵害船舶抵押权给抵押权人造成的损失（如非法损坏抵押船舶导致价值减少的损失）。办理抵押登记责任，判令抵押人协助抵押权人办理船舶抵押登记手续，或办理抵押权变更、注销登记手续。消除妨害责任，判令侵权人排除对抵押权人行使抵押权的妨害（如停止对抵押船舶的非法查封、扣押，不得阻碍船舶的拍卖、变卖）。
